PCR原理
PCR技术的基本原理类似于DNA的天然复制过程，其特异性依赖于与靶序列两端互补的寡核苷酸引物。PCR由变性--退火--延伸三个基本反应步骤构成：
1、模板DNA的变性：模板DNA经加热至93℃左右一定时间后，使模板DNA双链或经PCR扩增形成的双链DNA解离，使之成为单链，以便它与引物结合，为下轮反应作准备。
2、模板DNA与引物的退火(复性)：模板DNA经加热变性成单链后，温度降至55℃左右，引物与模板DNA单链的互补序列配对结合。
3、引物的延伸：DNA模板--引物结合物在TaqDNA聚合酶的作用下，以dNTP为反应原料，靶序列为模板，按碱基互补配对与半保留复制原理，合成一条新的与模板DNA链互补的半保留复制链，重复循环变性--退火--延伸三过程就可获得更多的“半保留复制链”，而且这种新链又可成为下次循环的模板。每完成一个循环需2～4分钟，2～3小时就能将待扩目的基因扩增放大几百万倍。
PCR最初概念是类似基因修复复制，1971年由 Dr. Kjell Kleppe提出。现今所发展出来的PCR是1983由Dr. Kary B. Mullis发展出的，Dr. Mullis 于1985年发表了第一篇相关的论文。随后PCR技术在生物科研和临床应用中得以广泛应用，成为分子生物学研究的最重要技术。Mullis也因此获得了1993年诺贝尔化学奖。
PCR 和RT-PCR
聚合酶链式反应 (Polymerase Chain Reaction)简称为PCR，是一种分子生物学技术，用于放大特定的DN****段。可看作生物体外的特殊DNA复制。
逆转录PCR，或者称反转录PCR(reverse transcription-PCR, 简称为RT-PCR)，是聚合酶链式反应(PCR)的一种广泛应用的变形。在RT-PCR中，一条RNA链被逆转录成为互补DNA，再以此为模板通过PCR进行DNA扩增的方法。由一条RNA单链转录为互补DNA(cDNA)称作“逆转录”，由依赖RNA的DNA聚合酶（逆转录酶）来完成。随后，DNA的另一条链通过脱氧核苷酸引物和依赖DNA的DNA聚合酶完成，随着每个循环倍增，即通常的PCR。原先的RNA模板被RNA酶降解，留下互补DNA。RT-PCR的指数扩增是一种很灵敏的技术，可以检测很低拷贝数的RNA。RT-PCR广泛应用于遗传病的诊断，并且可以用于定量监测某种RNA的含量。
PCR和RT-PCR用于病毒抗原的诊断，主要用检测病毒。PCR用于检查DNA病毒，RT-PCR用于检测是RNA病毒。
PCR技术相关技术
筑巢法PCR(nested－primer PCR)，是先用一对外侧引物扩增获得的基因的一些大片段，再用第二套内侧引物以大片段为模板再扩增。通常先用外侧引物扩增若干周期，再加入内侧引物，使PCR效率大大增加。
时实PCR(real time PCR)，属于定量PCR（Q-PCR）的一种，以一定时间内DNA的增幅量为基础进行DNA的定量分析。
实时荧光定量PCR体系的设计与优化
标记PCR(Labelled Primers，LP-PCR)，LP-PCR是利同位素或荧光素对PCR引物的5'端进行标记，用来检测靶基因是否存在.彩色PCR的一种方法。
反向PCR(reverse PCR)是用反向的互补引物来扩增两引物以外的未知序列的片段的一种方法。
重组PCR，使两个不相邻的DN****段重组在一起的PCR称为重组PCR(recombinant PCR)。
多重PCR(multiplex PCR)，又称多重引物PCR或复合PCR，它是在同一PCR反应体系里加上二对以上引物，同时扩增出多个核酸片段的PCR反应。
不对称PCR(asymmetric PCR)，是用不等量的一对引物，这对引物分别称为非限制引物与限制性引物，主要用于核酸序列测定。
免疫-PCR(immuno-PCR)，是新近建立的一种灵敏、特异的抗原检测系统。它利用抗原-抗体反应的特异性和PCR扩增反应的极高灵敏性来检测抗原，尤其适用于极微量抗原的检测。
