有些原虫可以在动物身体不同组织中寄生。一般在死后剖检时，取一小块组织，以其切面在载玻片上做成触片或抹片，染色后检查。抹片或触片可用姬氏染色法或瑞氏染色法。
泰勒虫病的病畜，常呈现局部的体表淋巴结肿大，采用淋巴结穿刺，抽取内容物，染色后，镜检。
家畜患弓形虫病时，生前诊断可取腹水，染色后，查找滋养体(照片1-6-1、1-6-2)。
照片 1-6-1 猫弓形虫孢子化卵囊 大小为10μm×12μm(自Michael.R) [attachment=1166]
照片1-6-2 猫弓形虫卵囊 大小为10μm×12μm(自Michael.R) [attachment=1167]
